Genomické testování hýbe světem chovu skotu.
Selektovat otce? Jasně, vyberu si dobré býky, zlepší budoucí ekonomiku stáda. A selekce jalovic a krav? Je potřebná, ale dělá se obtížně. Selektovat bez znalosti genetického založení a jen dle původu či fenotypu, to je jako selektovat za naprosté tmy. Nebylo by lepší si na tu selekci trochu posvítit? Jasně, genomovat!
"Jak? Za kolik? S kým? Každý říká, že nabízí to nejlepší... jak se v tom mám vyznat?," říkáte si...
Jako si na trhu můžete koupit auta různé kvality a různých značek a každý prodejce prodává "jednoznačně to nejlepší", tak i na poli genomického testování najdete různé varianty. Není každé pivo stejně dobré, není každé prádlo stejně pohodlné. A někdy je dobré podívat se raději na objektivní čísla a měřitelné hodnoty. Nikdo z nás si jistě nemůže dovolit selektovat jalovice nepřesně a chybovat.
Spolehlivost selekce a testů
Na trhu naleznete několik variant testu, přičemž to zcela zásadní a podstatné je jejich spolehlivost, s jakou jsou publikovány. Pro zootechnika nebo šlechtitele je spolehlivost první věc, která musí být rozhodující, abyste mohli činit správná chovatelská rozhodnutí. Jak se jí dosahuje? Především je to doba sběru dat v databázi a jejich rozsáhlost. Čím déle a čím více nasbíraných dat o genotypu a fenotypu krav v určité databázi je, tím přesnější je i odhad plemenných hodnot jalovic, budoucích dojnic. Nechte hovořit čísla - dohledejte si ve veřeně dostupných datech informace o tom, jak rozsáhlá je referenční populace krav, na jejímž základě se počítají plemenné hodnoty jaloviček.
Genomika se dá laicky přirovnat k navigaci, kterou používáme při cestování v autě. Čím více dat z provozu má, tím rychleji a spolehlivěji vás dovede do cíle.
Genomičtí býci
Nepochybuji, že v připařovacích plánech máte i nějaké genomáky. Možná jste se jim v minulosti i dlouho vyhýbali, ale ono to donekonečna nejde. Genomáci jsou užitečný způsob, jak šlechtit stádo rychleji, ale může si někdo dovolit připouštět až ze třetiny býky, u kterých se později ukáže, že za moc nestojí? Ekonomicky zcela určitě ne. Je proto opravdu na místě být obezřetný. Míra spolehlivosti genomického testu mi říká, do jaké míry si mohu dovolit tohoto býka nasadit do připařovacího plánu. Čím nižší spolehlivost, tím více je potřeba být opatrný. Čím vyšší spolehlivost, tím častěji býka mohu nasadit.
Všimněme si jedné věci: dostávají se někdejší hvězdy genomických TOP listů také do TOPky prověřených býků? Nebo, jakmile se začnou telit dcery genomických býků a oni získají prověření, tak se po nich "slehne zem" a v katalozích už ho nenajdete? Inu, jejich genomická plemenná hodnota asi moc spolehlivá nebyla. Vybrali byste si je pak jako prověřené na dcerách? Asi raději ne. A není se čemu divit.
Genomika jalovic ve stádě slouží k něčemu jinému
Genomika jalovic je skvělý nástroj, pokud se používá správně. Máte již k dispozici dostatečně spolehlivá data jaloviček? Výborně, využijte je k brzké selekci a dělení do kvalitativních kategorií. Vyberte si ty, které chcete aby vám porodily zase jalovičku do obratu - na těchto nešetřete na ceně genetiky nebo kvalitě inseminační dávky, je rozhodně škoda, aby ty nejlepší jalovice rodily bezcenné holštýnské býčky. Dále snadno identifikujete zvířata nezajímavá - to jsou jalovice, které prodáte nebo je budete dojit, ale jejich dcery do obratu nepotřebujete a jen by vám zabíraly misto na jalovárně. Tady naopak prostor ušetřit na ceně inseminační dávky je, lze z ní získat tele hodnotné jinak - tedy připustit masňákem a tele poslat do výkrmu.
Rozsah testu
Co laboratoř a populace, to jiný rozsah testu. Záleží hlavně na tom, s kým kdo pracuje a jaké informace potřebuje vědět. Pokud se spokojíte s méně spolehlivými systémy testování, pak doporučuji obrátit se na jiné poskytovatele. U Inplemu naleznete dvě varianty testu, obě vysoce spolehlivé na bázi CDCB: V20 a V50. Neliší se spolehlivostí a přesností informací, liší se však rozsahem informací. V50 je kompletní test plně využitelný pro účely Chormosomal Matingu, představuje standard v genomickém testování.
V20 je test, který představuje hodně muziky za málo peněz. Představuje spolehlivou základní paletu informací o plemenici, produkční znaky, základní znaky konformace a RCI (vhodnost pro dojení robotem), EcoFeed a také informace, pro které dnes řada chovatelů posílá chlupy na ČMSCH, tedy beta kasein, kappa kasein, beta laktoglobulin, letální faktory, bezrohost nebo kontrolu původu. Nutno dodat, že tento test v současné době je srovnatelně finančně náročný, jako jen např. vlastní test na pouhý beta kasein v české laboratoři.
Co mají testy V20 a V50 společné?
Vysoká spolehlivost - standard CDCB.
Základní selekční indexy: TPI, NM.
Produkční znaky: produkce mléka, hmotnost a % tuku a bílkoviny.
Zdraví: DPR, livability, PSB, dlouhověkost.
Haplotypy: bezrohost, beta-kasein, kappa-kasein, betalaktoglobulin, HMW.
Efektivita a ekonomika: EcoFeed. Vhodnost pro dojení robotem: RCI (robotic cow index).
Kontrola původu a možnost mít SNP čip.
Cena rozboru se liší dle jeho rozsahu. Je vždy třeba myslet na to, k čemu a jak chci výsledky genomiky využít. Jak přesné a jak rozsáhlé soubory dat potřebuji. A je dobré mít na paměti, že jde o jednorázovou investici za život plemenice, která nepřevyšuje cenu jedné ID slušné kvality.
- samičí profil V20 od 550 Kč
- samičí profil V50 od 650 - 990 Kč
- dílčí testy od 150 Kč
Cena je stanovena dle sazebníku nebo smluvně dle konkrétních podmínek. Njesou účtovány žádné další poplatky a doplatky za doplnění objednaného testu, za využití v matingu ani za aktualizaci PH do věku 4 let plemenice.
Kdy se hodí?
V20
Zajímají vás kaseiny, ale oceníte i jiné infromace. Začáníte s genomikou a chcete si ji "oťukat"
Základní charakteristka testu: Základní screening stáda. Možnost pozdějšího zpoplatněného upgrade u vybraných plemenic, Hodně muziky za málo peněz.
V50
Máte zájem o širokou paletu výsledků, indexů, zajímá vás i typ a plný lineár. Kontrola nad letálními haplotypy a mírou inbreedingu. Efektivní využití Chromosomal Matingu.
Základní charakteristka testu: Plná kontrola nad profilem každé jalovice. Optimální pro plné využití potenciálu Chromozomálního matingu.
Dílčí testy a další laboratorní vyšetření
Laboratorně lze vyšetřit další markery nebo provést jiné rozbory tkání.
Freemartinismus
Vyšetřuje se z krve nebo z ušního štěpu. Lze kombinovat vyšetření freemartinismu i genomiky. Do laboratoře v USA se zasílá jeden vzorek, ze kterého se vyšetřuje freemartinismus a v případě negativity se pokračuje standardním genomickým testováním za účelem odhadu plemenných hodnot.
Beta kasein
Populární vyšetření odhalující genetické založení pro produkci beta kaseinu. Toto vyšetření lze provést odděleně nebo jako součást genomického testu V20 nebo V50.
Cena: 400 Kč
Kappa kasein
Cena: 720 Kč
Beta laktoglobulin
Cena: 720 Kč
Dominant RED
Cena: 720 Kč
MC1R
Gen MC1R u holštýnského skotu primárně určuje produkci černé a červené barvy srsti. Dominantní alela způsobuje černou barvu, zatímco recesivní alela je spojena s červenou barvou.
Calpain 316/530
Označuje dva konkrétní SNP markery v genu CAPN1, které jsou spojeny s křehkostí masa, tedy s kvalitou hovězího po porážce.
Arachnomelie
Vzácná dědičná vývojová vada skeletu, která je letální. Postižené tele se rodí mrtvé nebo hyne krátce po porodu.
Plemena: Brown Swiss a Simmental
Brachyspina
Letální dědičná vada u holštýnského skotu způsobující zkrácení páteře, sníženou plodnost a úhyny telat. Identifikace nositelů pomocí DNA testování umožňuje eliminaci vady z chovu.
CVM
Komplexní vertebrální malformace je smrtelná genetická vada u holštýnského skotu. Způsobuje zmetání, mrtvorozenost nebo deformace páteře a končetin u telat.
Cena: 720 Kč
Citrulinémie (CIT)
Vážné dědičné metabolické onemocnění u holštýnského skotu způsobené nedostatkem enzymu argininosukcinát syntetázy. Vede k hromadění citrulinu a amoniaku v krvi.
DUMPS
Autosomálně recesivní genetická vada. Homozygotní zvíře postrádá enzym UMPS, který je nezbytný pro syntézu nukleotidů.
Faktor XI
Dědičná porucha krevní srážlivosti, která se projevuje zvýšenou náchylností ke krvácení a sníženou plodností.
FMO3
Gen FMO3 u skotu souvisí s ojedinělou, ale technologicky významnou vadou mléka, tzv. rybím zápachem.
Cena: 720 Kč
HCD
Dědičná vada u holštýnského skotu způsobující neschopnost organismu správně metabolizovat a transportovat cholesterol. U telat vede k vážným zdravotním problémům.
Cena: 625 Kč
SMD
Patologický stav, při kterém dochází k nesprávnému vývoji nebo poruše tvorby myelinové pochvy nervových vláken v míše.
Specifické pro plemeno Brown Swiss.
SMA
Spinální svalová atrofie. Telata vykazují svalovou slabost obvykle kolem 15. dne života, která může vést k ochrnutí všech čtyř končetin a polehávání.
JNS
Autosomálně recesivní onemocnění specifické pro plemeno Jersey. Postižená telata se rodí s těžkým postižením nervové soustavy, nejsou schopná se postavit ani sát a brzy hynou nebo jsou utracena. Nosiči jsou klinicky zcela zdraví.
Cena: 400 Kč
AM
Arthrogryposis Multiplex je letální dědičná vada skotu, nejčastěji popsaná u plemene Angus. Postižená telata se rodí s těžkými deformacemi končetin, často také s rozštěpem patra a deformací páteře.
Cena: 400 Kč
Ceny jsou uvedeny bez DPH.
Máte dotaz k tomuto tématu?
Naši specialisté Vám rádi poradí s reprodukcí, genetikou, šlechtěním i každodenní praxí v chovu skotu.
Kontaktovat specialistu